2014年5月20日，上海的甲公司与北京的乙公司签订了一份买卖合同，约定：甲公司向乙公司购买100吨大米，总价款为200万元；乙公司在合同签订后1个月内将货运至甲公司指定的仓库，甲公司在验货后7日内付款。合同签订后，为担保甲公司按期付款，甲公司以小汽车一辆做抵押，签了抵押合同但未办理抵押登记。由于小汽车的价值仅为100万元，甲公司又请求丙公司为该笔借款提供了保证担保。乙与丙公司的保证合同没有约定保证方式及保证范围，但约定保证人承担保证责任的期限至借款本息还清时为止。
6月10日，乙公司准备发货时，甲公司的竞争对手告知乙公司，甲公司经营状况不佳，将要破产。乙公司随即暂停了货物发运，并电告甲公司暂停发货的原因。甲公司告知乙公司：本公司经营正常，货款已经备齐，而且货款支付已有担保，乙公司应尽快履行合同，否则将追究违约责任。6月25日，乙公司向铁路运输部门支付了运费并发货。货物在运输途中，遇泥石流灾害全部灭失。乙公司要求甲公司付款，甲公司则认为自己没有收到货物，无需支付。
根据上述内容，回答以下问题：

乙公司是否有权要求运输部门退还所支付的运费？